Assembleia Geral
Instância máxima do CONLESTE, é o Órgão Colegiado composto pelos Chefes do Poder Executivo de todos os entes Consorciados, reunir-se-á ordinariamente duas vezes por ano e, extraordinariamente, sempre que convocada.

Presidência
Cabe ao PRS, representar o Conleste, ativa e passivamente, judicial ou extrajudicialmente, podendo firmar contratos ou convênios. Bem como, constituir procuradores ad judicia e ad negotia, podendo esta competência ser delegada parcial ou totalmente ao Diretor Geral, mediante decisão da Assembleia Geral.

Diretor Geral
Cabe ao Diretor Geral (DG), administrar e representar o Conleste, dentro dos limites estatutários e regimentais, em consonância com os princípios, finalidades e objetivos do mesmo, responder pela execução de todos os programas e atividades do Consórcio.

Diretoria de Planejamento e Projetos
Cabe ao Diretor de Planejamento e Projetos, administrar o planejamento estratégico, subsidiando a Diretoria Geral e Presidência na realização dos projetos do Conleste. Assegura a direcionalidade da gestão institucional, a eficiência e eficácia no cumprimento dos objetivos e metas definidas. Desenha as políticas e processos, realiza o levantamento e análise das informações a fim de contribuir na elaboração de planos de ação para alcance dos objetivos do Conleste.

Diretoria de Energia e Inovação
Propagar o Conleste junto à mídia, digital, escrita e falada;
Coletar, tratar e divulgar as informações de interesse do Conleste;
Acompanhamento da divulgação das atividades municipais, nacionais e internacionais relacionadas ao Conleste;
Desenvolvimento de projetos que envolva os objetivos do Conleste na área de marketing e de Relações intermunicipais;
Elaborar, coordenar e implantar o plano de marketing e comunicação;
Desenvolvimento de projetos que fomentem as atividades das Relações intermunicipais do consórcio;
Promover a imagem do Conleste as relações internacionais, nacionais e intermunicipais, às atividades junto a todos os tipos de mídia;
Zelar pela busca e divulgação de informação entre o Conleste a Órgãos Públicos, Privados e a Sociedade;
Desenvolver campanhas publicitárias definidas pela Diretoria;
Encaminhar os projetos para a apreciação da Diretoria;
Coordenar e supervisionar as ações relacionadas ao site do Conleste na internet e novas tecnologias de comunicação e redes sociais;
Coordenar os sistemas de informação interna do Conleste e conteúdo público de informação do Conleste sob a orientação do Presidente e do Diretor Geral;
Estimular e promover a difusão de conhecimentos científicos, técnicos e tecnológicos nas diversas áreas de abrangência das entidades participantes;
Estimular a realização de eventos técnicos, dentro do escopo do planejamento estratégico do Conleste;
Estimular e divulgar viagens a eventos técnicos no Brasil e no exterior, bem como missões empresariais dentro do escopo do planejamento estratégico do Conleste.

Secretaria Executiva/Administrativa
Cabe a Secretaria Executiva/Administrativa  assessorar e assistir todas as diretorias em sua representação funcional e administrativa de interesse da pasta, inclusive a Presidência;

Gerência de Operações
Cabe a Gerência de Operações, embora seja um órgão subordinado diretamente a Diretoria Geral, assessorar também a Presidência no exercício de suas atribuições e assisti-los no exame e na condução dos assuntos estratégicos afetos em sua atuação.

Conselho Consultivo
As atribuições deste Conselho são de consultoria, sem qualquer função deliberativa.

Conselho Fiscal
O Conselho Fiscal é órgão de fiscalização do Consórcio composto por Conselheiros indicados pela Assembleia Geral do CONLESTE em número de três membros efetivos e três suplentes.